A Vietcong 2 történet
a Hue-i Tet Offensive alatt játszódik. A játékos a kiábrándult amerikai MACV-katona, Daniel Boone kapitány szerepét ölti magára (a Daniel Boone MACSOG-hadműveletről kapta a nevét). Boone egy ausztrál, új-zélandi és kanadai nemzetközi erőkből álló koalíció tagja.
A játék lehetőséget ad
a játékosnak arra is, hogy egy másik perspektívából vívja meg a háborút, mint egy fiatal vietkong toborzó, aki a Tet Offensive előtt és alatt harcol. Ez a kampány feloldódik, ha a játékos befejezte az amerikai kampány egy bizonyos részét.
